刻针灸问对叙序卷之上卷之中三才法候气法十四法卷之下十五络脉歌周身经穴相去分寸歌肺经大肠经胃经脾经心经小肠经肾经膀胱经心包络经三焦经胆经肝经督脉任脉经穴起止歌十二经纳支干歌天心十一穴歌经脉交会八穴歌八会
内外伤寒辩惑论
简介自序集之一·初生门集之二·肝脏部集之三·心脏部一集之四·心脏部二集之五·心脏部三集之六·心脏部四集之七·脾脏部（上）集之八·脾脏部（下）卷之九·肺脏部·肾脏部
杂症会心录
简介奇效良方内容细目卷之一 风门（附论）（一）卷之二 风门（附论）（二）卷之三 风门（附论）（三）卷之四 寒门（附论）卷之五 暑门（附论）卷之六 湿门（附论）卷之七 燥门（附论）卷之八 火门（附论）卷
自序再自序合论诸书之得失以示初学之从违（四条）论读医书之难论诊病须知四诊论《景岳全书》论金匮肾气汤论倪涵初先生疟痢三方附录王子圣大归芍汤张洁古芍药汤附论噤口痢论吴又可《温疫论》（四条）论时邪论初诊用药
十问合阴阳天下至道谈胎产书杂禁方养生方却谷食气
眼科奇书
简介张序祁序女科上卷带下白带下（一）青带下（二）黄带下（三）黑带下（四）赤带下（五）血崩血崩昏暗（六）年老血崩（七）少妇血崩（八）交感出血（九）郁结血崩（十）闪跌血崩（十一）血海太热血崩（十二）鬼胎妇
救自缢良方救溺死救冻死救五绝救诸伤伤眼耳中毒箭鸟枪伤汤火伤诸物咬伤救诸毒物性相反误食伤人水毒避蛊毒挑生毒吞鸦片烟毒野芋毒